Le problème, c'est que Windows, plutôt que de montrer une box pour pouvoir ressaisir ses identifiants, préfère indiquer ce message... et on se retrouve bloqué, à moins de passer par un outil graphique comme le GitHub Desktop.

Toutefois, il existe un moyen pour pouvoir forcer le Git Shell à redemander le mot de passe. Dans une console en tant qu'administrateur, exécuter les commandes suivantes:

git config --global --unset user.password
git config --system --unset user.password
git config --system credential.helper store

Normalement, après le prochain git pull, le Git Shell redemandera le login, puis affichera une box pour saisir le mot de passe. A noter que l'option store supporte plusieurs paramètres et que par défaut sous windows, c'est wincred qui est utilisé au lieu de store.